档案整理首先要保持历史联系的关联性
某些档案材料由于保存的时间较长，其自身和档案整理体系都会发生某些变化，也要对其进行相应的调整。对零散文件的整理，且对档案进行全过程的整理工作，包括区分全宗类档案的分类。整理工作的基本原则是大方向的整理，首先就是必须保持文件之间真实历史的联系，而文件之间历史联系主要体现为文件在其来源、形成、时间、内容和形式等方面密不可分的关联性。因此我们这个原则，首先要保持文件之间这种历史联系以及各个方面的关联性。
档案整理方法需要不断优化和创新
目前对于传统的案卷级企业档案整理方法所存在的问题和整端，有效的是在企业档案整理过程中引入计算机技术，计算机档案信息管理系统得到广泛应用分析，能够对传统的档案整理方法进行改进，使以往档案整理中存在的问题得以解决，同时为了促进档案整理方法的改革，进一步提高企业档案整理质量和效率，需要对档案整理方法不断优化和创新，对能够更好地适应企业档案管理实际情况的整理方法加强实践应用分析。
档案整理的质量由人员水平和管理人员决策共同决定
档案整理工作的质量会直接受到档案管理人员业务水平高低的影响，为了提案管理人员的业务水平，让其能够更好的适应档案组织整理工作的需要，尽可能的调动工作人员的工作积极性，增强他们的工作责任心。由于积存文件特别是零散文件不管是从种类上还是从载体上来说，都具有多样化的特点，所以还需要及时更新管理方法，这就对档案管理人员提出了更多的要求。