水源染是“两虫”疾病大的源，后的救治成本远高于提前预防成本，已成为各国需要防控的公共卫生疾病。我国于2006年颁布的《生活饮用水卫生标准》在微生物学指标中增加了“两虫”的检验，对饮用水“两虫”指标进行监测的重要性可见一斑。“两虫”严重威胁着人们的饮用水，水质监测单位面临着严格的考验。
水体中“两虫”的检测方法多为磁分离法和荧光法。磁分离操作过程繁锁、要求手工操作且操作者需十分细心，仪器使用成本高、维护困难，检测难度较大，一定程度上限制了该检测法的实用性及普及性。荧光法借助的荧光显微镜来区分杂质和两虫。
利用去除有机杂质,利用消除絮凝剂的影响
由于再生水的水质具有有机物、微生物等含量高的特点,在样品预处理中需要去除各种干扰显微镜检查的杂质。另一方面,再生水目前采用不同的处理工艺,其中常规的混凝处理造成水中残留的混凝剂会影响两虫的分离。利用去除有机杂质,利用消除絮凝剂的影响,建立了应用于再生水的“两虫”检测方法。再生水进出水隐孢子虫卵囊和贾第鞭毛虫包囊的回收率分别为18%-31%和24%-95%,我国规定饮用水中两虫检测的初始回收率要求控制在10%-(GB/T 5750.12-2006)。
EPA1623方法的操作简介
“EPA1623方法"是由美国国的用于测定水中隐孢子虫和贾第鞭毛虫的标准方法。概况地说，该方法分为三部。，水样进行过滤收集水中的乱囊和孢囊；第二，利用磁分离来纯化过滤样品；第三，对纯化的样品通过荧光显微镜法来监测“两虫"的数量。
1、水样过滤
将卵囊、孢囊及其他无知收集在过滤器上。该过滤器可用于实验室批量水样的过滤，也可以用于野外现场水样的过滤。过滤后的囊式滤器，用洗脱剂将拦截在滤囊上的颗粒物震荡洗脱下来，并将洗脱物收集在一个250毫升的离心管中。
两虫检测囊式过滤器:水样过滤囊式滤器安装好，过滤器的滤囊用震荡器进行洗脱分离。
特点
1um孔径的改良滤膜能截留两虫。
一次性使用的设计避免了因其他因素的污染而造成的实验结果误差。
于源水与自来水的隐孢子虫与贾第鞭毛虫的浓缩与回收，使用简单、方便、快捷。
两虫”的防控
水是人之生存根本。从饮用水的安全角度出发，应重视两虫对人体健康的危害，加强从到用水点的全流程控制和去除灭活，限度降低“两虫”危害。
饮用水处理中使用的常规氯消毒剂不能有效地灭活两虫，去除或灭活两虫的物理方法中，反渗透法、膜过滤法、冻融法等成本较高，不适合大规模应用。紫外线法能较有效地灭活两虫，但紫外线穿透力弱，不利于灭活较深水层处的两虫。在化学法中，臭氧氧化法对两虫的灭活效果。采用多种消毒剂联合使用，通过协同作用，可达到较高的灭活率。