档案整理首先要保持历史联系的关联性
某些档案材料由于保存的时间较长，其自身和档案整理体系都会发生某些变化，也要对其进行相应的调整。对零散文件的整理，且对档案进行全过程的整理工作，包括区分全宗类档案的分类。整理工作的基本原则是大方向的整理，首先就是必须保持文件之间真实历史的联系，而文件之间历史联系主要体现为文件在其来源、形成、时间、内容和形式等方面密不可分的关联性。因此我们这个原则，首先要保持文件之间这种历史联系以及各个方面的关联性。
对档案进行全宗的整理会更加简洁有效
档案的整理必须在保持文件之间历史联系的基础上，采用更简洁、有效的方法，使整理的档案便于保管和利用。档案是要用于保管以及提供利用。在整理过程中，前面提到的一步就是全宗的组织，那么我们来认识一下对全宗如何进行组织呢？通常以通俗的定义来看，就是按照全宗群来组织和排列馆藏全宗，即把统一时间、同一系统或相同性质的全宗排列在一起以保持同类全宗之间的联系性。
档案整理工作方案的制定
为了使积存零散档案文件的整理工作能够顺利地进行，在整理以前，应先了解档案的情况，订出一个整理工作方案。此工作方案包括以下内容:立档单位的历史沿革和档案状况，整理的要求和具体方法，工作程序劳动组织，以及各工作完成时间。根据所要整理的档案状况、数量以及参加整理人数的不同，来针对性制定方案，整理工作方案可详可简。整理工作方案一般以全宗为单位编订。整理互有联系或同类型若干全宗时，也可以合编一个整理工作方案。
档案案卷的加工整理和运筹方向
档案案卷的加工整理内容: 案卷内文件编号，填写卷内文件目录和卷末备考表，卷内文件技术修整，填写案卷封面，案卷装封等; 确定各类内案卷的排列顺序和案卷编号，编制案卷目录。以上这些序列步骤，只是系统地整理零散文件的一般程序。在实际工作中，应根据不同情况，因档案的状况和整理的具体要求而采取相应的程序安排。从上述步骤的全过程可以看出如下特点:零散文件整理程序，是在档案整理工作基本程序的基础上，有规律地交错结合而组成的;零散文件的整理程序及其实际运用较为复杂，但如运筹得当，却又可能摆脱材料由文书部门经档案室到档案馆这种常规流程所造成的限制，而把整理工作程序组织的更为科学。
