殖尾水的处理，在操作上必须简单化，让养殖工人容易操作，适应目前养殖场的员工实际工作能力。在经济上必须可行，才能够不会使养殖成本明显升高失去养殖的经济意义。在尾水的处理系统必须相对稳定，不容易被养殖操作因素或者气候因素干扰甚至崩溃。因此：养殖尾水处理如果一味搞高大上，直接模仿河涌污水原位处理的方式方法，可能在经济上或者实际操作过程中就不一定能够适应对虾养殖目前的状况。
尾水治理主要技术原理：主要采取了沉淀、过滤、曝气、生物净化等技术手段，其中对一般污染养殖尾水（养殖品种主要有青虾、黄颡鱼、翘嘴红鲌等）采用二坝三池模式（二个过滤坝加上沉淀池、曝气池、生态净化池）；对较严重污染的养殖尾水（养殖品种主要为黑鱼）采用三坝四池模式（三个过滤坝加上深沉池、曝气池、生态净化池、生物净化池）。
水产养殖污染现状 “水产养殖环境污染由外源性和养殖自身污染构成”，自身污染源于养殖过程中的投入品、池底污泥及水产排泄物，而外源性污染源于生活污染、农业面源污染和工业污染等。除了不可抗力，外源性污染源主要是通过养殖进水混入养殖水体，造成养殖用水水质从源l头不达标的窘境。
根据水产养殖问题的实践调研显示，很多养殖者将禁止直接排放的生活污水、生产废水等注入鱼塘，并通过植物进化降低或降解污染物使其符合养殖废水排放标准进而达致合法排污的目的。